Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrioQ0KL02 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms