Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb5Q02739 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms