Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GscQ02591 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms