Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grin2cQ01098 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms