Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ptprn2P80560 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptprn2P80560 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms