Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms