Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp2P63044 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp2P63044 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms