Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab3cP62823 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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