Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PlnP61014 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
PlnP61014 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PlnP61014 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PlnP61014 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms