Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

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Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CgnP59242 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms