Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ctdsp1P58466 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ctdsp1P58466 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ctdsp1P58466 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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