Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms