Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms