Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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