Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CitP49025 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CitP49025 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CitP49025 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CitP49025 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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