Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ItgavP43406 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms