Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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LtbP41155 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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