Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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