Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms