Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc11P31313 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms