Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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