Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
OatP29758 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OatP29758 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
OatP29758 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OatP29758 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OatP29758 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OatP29758 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OatP29758 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms