Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxraP28700 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RxraP28700 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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