Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VimP20152 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VimP20152 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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