Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms