Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms