Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P10404 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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P10404 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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P10404 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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