Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms