Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01736 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01736 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01736 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms