Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P01649 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01649 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms