Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01646 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01646 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01646 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01646 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms