Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01644 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01644 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01644 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01644 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01644 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01644 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01644 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01644 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01644 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms