Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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P01641 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01641 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01641 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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P01641 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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P01641 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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P01641 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01641 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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