Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms