Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Copb2O55029 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Copb2O55029 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Copb2O55029 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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