Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChkaO54804 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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