Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc27a2O35488 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms