Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms