Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17078M0QW51 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17078M0QW51 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms