Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20939L7N243 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20939L7N243 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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