Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn2r88L7N1W8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms