Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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