Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8356J3QPD3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms