Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms