Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms