Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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