Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms