Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17333C6EQI3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms