Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms