Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apba1B2RUJ5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms